【智能生物设计方向】客座学生

来源:发布时间:2020-12-15

PI简介

乔宇博士,中国科学院深圳先进技术研究院研究员,博士生导师,数字所所长。乔宇研究员课题组长期关注深度学习等人工智能方法的基础研究与应用开发,用于计算机视觉、生物医学信息、合成生物设计等领域的研究。共发表学术论文210余篇,在JCR-Q1CCF-A类期刊会议发表论文90余篇,被引用超过17000次,h-index54;在ChaLearnLSUNActivityNet等重要国际竞赛中12次获第一名;多项技术成功转移到企业,并应用广泛。

 

实验室主页http://mmlab.siat.ac.cn

 

合作PI简介:司同博士,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所研究员,博士生导师。课题组主要方向为自动化合成生物技术,基于高通量实验和数据驱动方法开展蛋白质和代谢工程研究,用于燃料、药物、精细化工品等重要分子的研究与生产。在Nat CommunJACS等国际著名期刊发表论文和论著30余篇,“谷歌学术”引用超过1600次。


客座学生

职位月薪:2000-4000

工作性质:实习

工作经验:不限

招聘人数:1-2

 

岗位描述:

近两年,自然语言处理作为人工智能皇冠上的“明珠”,在理解和生成两方面都取得了巨大的进步。而DNA、蛋白质等作为“生命语言”,仍待有志青年和聪明的大脑去解密。乔宇研究员课题组结合中国科学院先进技术研究院合成生物研究的优势资源,将人工智能方法应用到合成生物设计领域,试图解密生命的语言以辅助设计具有目标性能的生命体。

具体描述如下:

1.      非氧依赖荧光蛋白序列活性预测、与序列优化。拟采用基于梯度、进化、强化学习等方法。

2.      数据驱动的实验设计。拟采用主动学习、贝叶斯优化、强化学习等方法。

 

岗位要求:

1.      计算机科学与技术、生物信息学、计算生物学等相关专业高年级本科生或研究生;

2.      有扎实的数理基础(包括统计、优化)及编程能力;

3.      有深度学习、自然语言处理、计算机视觉等相关学习或科研经历;

4.      可保证1年或以上实习期;

5.      有志于从事人工智能与合成生物交叉领域研究;

6.      身心健康;

7.      具有良好的沟通能力与团队协作精神。

 

其他说明:

合成生物及人工智能应用介绍见相关链接:

1.      合成生物研究路线图:https://roadmap.ebrc.org/

2.      合成生物核心目标:https://www.ibiology.org/bioengineering/engineering-microbes/

3.      蛋白质结构预测模型AlphaFold2https://deepmind.com/blog/article/alphafold-a-solution-to-a-50-year-old-grand-challenge-in-biology

4.      机器学习在蛋白质工程中的应用:https://www.nature.com/articles/s41592-019-0496-6

 

福利待遇

免费宿舍,餐费补助

交通费和体检费报销

统一购买保险

成果奖与奖学金

 

申请方式

有意申请者请将个人简历以邮件方式发送至ry.hu@siat.ac.cn,邮件标题注明应聘岗位-学校名称-专业-姓名,并将个人简历以附件(PDF格式)随邮件发送,简历命名方式请与邮件标题保持一致。