蔡云鹏， 中国科学院深圳先进技术研究院研究员，博士生导师，生物医学信息技术研究中心执行主任，广东省健康大数据分析技术工程中心主任，深圳市健康大数据分析技术工程实验室主任。主要研究方向为生物信息学、健康信息学、医学健康大数据挖掘及医疗人工智能。已发表学术论文一百余篇，包括作为主要作者在IEEE TNNLS、IEEE TOC、IEEE ICDE、Nucleic Acids Research等机器学习和生物信息学顶级期刊、会议上的多篇论文，已获得授权发明专利40多项。担任SCI一区期刊Health Information Science and Systems主编，主持国家自然科学基金、广东省应用型科技研发专项、国家科技支撑计划（子课题）、中科院先导专项课题等项目，曾担任国家863计划课题副组长。作为参与人获广东省科学技术奖二等奖2项，深圳市技术发明一等奖、中华医学会卫生管理奖各一项。

生物信息，医学信息，人工智能与机器学习，多模态数据融合，可解释性AI

1.Ruitao Xie; Jingban Chen; Limai Jiang; Rui Xiao; Yi Pan; Yunpeng Cai ; Accurate Explanation Model for Image Classifiers using Class Association Embedding, 40th IEEE International Conference on Data Engineering, Utrecht Netherlands, 2024
2. H Huang, X Shi, H Lei, F Hu, Y Cai, ProtChat: An AI Multi-Agent for Automated Protein Analysis Leveraging GPT-4 and Protein Language Model, Journal of Chemical Information and Modeling, 2024
3. Chaojie Ji; Yijia Zheng; Ruxin Wang; Yunpeng Cai; Hongyan Wu ; Graph Polish: A Novel Graph Generation Paradigm for Molecular Optimization, IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems, 2021
4. Chaojie Ji; Hongwei Chen; Ruxin Wang; Yunpeng Cai; Hongyan Wu ; Smoothness Sensor:Adaptive Smoothness-Transition Graph Convolutions for Attributed Graph Clustering, IEEE Transactions on Cybernetics, 2021
5. Y Cai, Y Sun, ESPRIT-Tree: hierarchical clustering analysis of millions of 16S rRNA pyrosequences in quasilinear computational time, Nucleic acids research, 2011